自考生在学习期间的档案统称为“学籍档案”，毕业时，自考生的学籍档案材料原件应尽快归到自己的人事档案中，存入相关人事部门。
自考生的学籍档案主要是《毕业生登记表》（全日制自考生还有《考生毕业审定表》），内容包括该毕业生姓名、专业、区县、每次参考时间、准考证及身份证号码、联系电话、毕业审核部门签署意见等重要证明信息。
自考毕业申请审核通过后，市考办会将自考生毕业证书和学籍档案材料原件密封后，发到自考生手中，自考生根据个人情况采取合理方式归入个人档案。

自考档案毕业后应该密封和全日制的档案合并，而全日制学籍档案一般都是毕业后，由学校邮寄到户籍地的人才中心，如果有签三方的话，看单位有无人事权，如果有人事权就派去了单位。如果没有人事权有可能派到了工作地的人才中心。找到原始档案后，将档案合并。

如果之前没有全日制学籍档案，那就需要根据档案以后的用途来新建一份档案了，补充相关手续，形成一份完整的人事档案。

人才市场可以寄存这一类的档案：人才市场是国家最专业的人事手续办理基地，那么这里可以寄存我们大中专毕业生的档案，然后可以慢慢的转正定级，但是主要是包括国家统招也就是国家统一招生考试被录取的学生毕业之后才有资格享受档案寄存，而自考本科不属于这一类范畴。自学考试毕业证不是全日制毕业证：我们都知道自学考试毕业证上面写得高等教育自学考试，而不是全日制的考试，所以自学考试毕业证相当于是自学考试而不是全日制统招毕业生，千万别以为有了本科学历，就可以证明自己有多么的伟大。自学考试毕业证不能存放在人才市场：因为自学考试很少有的是国家正规的编码，另外他的报到证也没有国家统一的标号，只有国家统一标号的报到证才能证明你在本公司工作，所以自学考试不能存放在人才市场，而大家千万别忽略了自学考试的劣势，一定要好好学习劝诫我们身边的人上一个好的学校有多么的关键。全日制本科助学班其实就是自学考试：大家都以为全日制本科助学班就是全日制，而忽略了其实他就是自学考试的旗号，然后在学校给你每天进行培训了之后，让你自己学习区参加了考试，这其实是按照自己的流程去学习也可以参加考试，每天学习就叫全日制，大家一定不要选择这样的学校，要不将来十分的麻烦。努力学习，考一个统招本科或者统招专科：只有统招的本科和专科才有国家统一颁发的报到证，才会根据你的报到证来人才市场进行户口转移，户籍登记，档案寄存，这样你就可以从普通员工升为干部，所以一定要好好学习，对你将来考公务员考国家正式单位有意义。