住院费用医疗保险通常可以在扣除了免赔额之后进行报销，但是不同的住院费用所能报销的比例、保额等有所差异，比如有的医疗险可以报销80%，有的医疗险可以报销50%。此外，部分医疗险还会有社保限制，比如如果用社保报销过，那么在扣除了免赔额后可以100%报销住院费用，但如果没有用社保报销，就只能报销80%。