医疗保险卡住院报销流程如下：

1、被保险人应携带医疗保险卡到指定医院，并在医生诊断后出具入院证明。

2、在医院窗口办理住院登记手续，并预付治疗所需的医疗费用。

3、携带本人或代理人的身份证原件、医疗保险卡进行办理。如果医疗保险卡意外丢失，为防止个人账户余额被盗用，市民应直接致电当地医保局服务大厅及时挂失。如果医疗保险卡失效，可以把你的身份证和原始卡带到健康保险局。如果医疗保险卡遗失，您需要持身份证复印件和您所在单位出具的介绍信办理手续。