农村医疗保险可以进行异地报销，但是需要提前做好异地备案。异地备案流程如下：

1、异地就医备案:患者到医院住院治疗前，可向参合机构申请异地就医转诊，或通过电话、短信、网络等方式与参合机构联系，申请或补办异地就医转诊。

2、异地定点医疗机构就医，医务人员开具住院证明。

3、患者凭身份证、社保卡、入院证明、转诊单或转诊短信通知办理入院手续，确保见证人一致。

4、病人住院。

5、患者出院后直接在新农合结算，自付费用。

6、医院向患者提供对账单和住院明细，保留原始发票，垫付新农合报销费用，并定期将账单送达患者所在的新农合经办机构。

如果没有转院证明新农合可以报销，但通常会降低报销比例，参保人(患者)只需携带本人身份证、新农合医疗证明、住院小结、住院医疗费用清单等资料到合作医疗管理办公室进行报销即可。